Командой "File -> Open..." ("Файл -> Открыть...") (либо комбинацией горячих клавиш "Ctrl+O") откроем изображение, фрагменты которого мы хотим заставить мигать.
http://s7.uploads.ru/oJasj.jpg

Теперь при помощи одного из инструментов выделения: "Mask" ("Маска"), "Lasso" ("Лассо"), "Magic Wind" ("Волшебная палочка") выделим те фрагменты изображения, которые мы хотим заставить мигать.
http://s6.uploads.ru/rao9S.jpg

Выделим те фрагменты изображения, которые мы хотим заставить мигать.
Нажатием комбинации "Ctrl+J" продублируем выделенное. В результате этого действия в палитре "Layers" ("Слои") появиться копия продублированного слоя.
http://s6.uploads.ru/t9HG5.jpg

Теперь поработаем с уровнями. Выберем только что созданную копию и командой "Image ->Adjustments -> Levels" ("Изображение -> Регулировки -> Уровни") (Ctrl+L) вызовем диалог "Levels" ("Уровни").
http://s6.uploads.ru/GHLVp.jpg

Здесь, исходя из личных соображений, выставляем значения параметров диалога, при этом затемняя или высветляя изображение. В результате у меня получилось следующее:
http://s6.uploads.ru/6jEN4.jpg
Итого:
http://s7.uploads.ru/A5Puf.jpg

В принципе, "мигающий эффект" уже достигнут. Но я предлагаю добавить ему плавности. Для этого продублируем слой с некогда выделенным фрагментом нужное количество раз (чем больше будет копий, тем плавнее будет мигать фрагмент). Для каждой копии выставляем значение "Opacity" ("Непрозрачность") (данную опцию ищите в палите "Layers" ("Слои")немного более высокое, чем для предыдущей. Допустим, у нас будет еще три копии. Тогда выставляем для них непрозрачность 35%, 60% и 85% соответственно.
http://s7.uploads.ru/v7LYI.jpg
(Выставим созданным слоям значения непрозрачности 35%...)
http://s6.uploads.ru/q1VEO.jpg
(...60%...)
http://s7.uploads.ru/Nzk27.jpg
(...и 85% соответственно)

Переключаемся на редактирование данного изображение в программе Image Ready (Shift+Ctrl+M). В ней вызываем диалог анимации и, нажимая на кнопку создания нового слоя, добавляем число слоев, в два раза большее числа уже имеющихся. У меня последних насчитывается ровно десять.
http://s7.uploads.ru/ZFQOh.jpg

Теперь ставим по два слоя в каждый кадр. При этом оставляем видимым самый нижний слой и его дубликат. Со всех остальных слоев значок глаза убираем, тем самым делая их невидимыми. Перейдя к следующему кадру, опять же, снимаем "глаз" со всех слоев, кроме самого нижнего и его дубликата.
http://s7.uploads.ru/PyMkh.jpg

Добравшись до середины, вы могли озадачиться:"А как быть с оставшимися пятью кадрами?". Все очень просто: необходимо произвести с ними аналогичные действия, но в обратном порядке. То есть при самой яркой середине ближе к "окраине" должно быть все тусклее и тусклее. Теперь переходим к следующему этапу нашей работы - выставлению времени. Нажатием по стрелочке, находящейся в нижней части слоя, вызываем меню временных интервалов.
http://s7.uploads.ru/zASgR.jpg

Выставляем нужные нам значения. Ну, допустим, 0.1 секунды. На первом кадре можно установить 0.5 секунды. Слишком высокие значения (больше секунды) ставить не советую, так как в этом случае пострадает плавность смены кадров. Ну, теперь осталось только сохранить результат. Для этого командой "File -> Save Optimized As..." ("Файл -> Сохранить оптимизированный как...") (Ctrl+Shift+Alt+S) вызовем диалог "Save Optimized As" ("Сохранить оптимизированный как") , выберем место сохранения на диске, укажем имя файла и его тип, после чего нажмем кнопку "Save" ("Сохранить").
http://s7.uploads.ru/L03hx.jpg

А вот и результат, над которым мы корпели на протяжении всего урока:
http://s6.uploads.ru/DsAGa.gif

Автор урока COLOR MATE